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Notice
 

GENOSOIL. Approche métagénomique pour l’étude de la biodiversité totale du sol. 5 mars 2014.
(Metagenomic insignts into the study of total biodiversity of soils).
A - Rapport final.- 84 p.
B - Synthèse du rapport final.- 14 p.

 
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Titre complémentaire
  • Contributions en annexe :
    - JAMES (SW), PORCO (D), DECAËNS (T), RICHARD (B), ROUGERIE (R), et al.- DNA Barcoding Reveals Cryptic Diversity in Lumbricus terrestris L., 1758 (Clitellata) : Resurrection of L. herculeus (Savigny, 1826).- in PlosOne 5 (12), E15629.,2010.- pp. 1-9
    Accès en ligne : http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0015629
    - RICHARD (B), DECAËNS (T), ROUGERIE (R), JAMES (S W), PORCO (D), HEBERT (PDN ).- Re-integrating earthworm juveniles into soil biodiversity studies : species identification through DNA barcoding. - in Molecular Ecology Resources, 10, 2010, pp. 606–614.
    http://dx.doi.org/10.1111/j.1755-0998.2009.02822.x
    Accès en ligne : http://www.researchgate.net/profile/Thibaud_Decaens/publication/232305360
    - DUPONT (L), LAZREK (F), PORCO (D), KING (RA), ROUGERIE (R), SYMONDSON (WOC), LIVET (A), RICHARD (B), DECAËNS (T), BUTT (KR), MATHIEU (J).- New insight into the genetic structure of the Allolobophora chlorotica aggregate in Europe us ing microsatellite and mitochondrial data.- in Pedobiologia – International journal of soil biology, 54(4), 2011, pp. 217-224.
    http://dx.doi.org/10.1016/j.pedobi.2011.03.004
    Accès en ligne : http://www.researchgate.net/profile/Thibaud_Decaens/publication/233970012
    - ROSSI (JP).- Rich: An R Package to Analyse Species Richness.- in Diversity, 3(1), 2011, pp. 112-120.
    Accès en ligne : http://dx.doi.org/10.3390/d3010112
    - PORCO (David), DECAËNS (Thibaud), DEHARVENG (Louis), JAMES (Samuel W), SKARZYNSKI (Dariusz), ERSEUS (Christer), BUTT (Kevin R), RICHARD (Benoît), HEBERT (Paul DN).- Biological invasions in soil : DNA barcoding as a monitoring tool in a multiple taxa survey targeting European earthworms and springtails in North America.- in Biological Invasions, Volume 15, Issue 4, 2013, pp. 899-910.
    http://dx.doi.org/10.1007/s10530-012-0338-2
    Accès en ligne : http://www.researchgate.net/profile/David_Porco/publication/235947918
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Source
  • Rouen : Université de Rouen, 2014 - bibliogr., ann.
 
Programme
de recherche
Résumé
  • Le projet GENOSOIL avait pour objectif principal de développer une méthode de quantification de la biodiversité du sol se basant sur une combinaison d’approches de taxonomie moléculaire mettant en oeuvre le barcode ADN et la métagénomique (barcode environnemental à partir d’échantillons totaux d’invertébrés et/ou d’échantillons de sol). La démarche s’appuie sur :
    - la constitution de bibliothèques de référence de barcodes ADN,
    - l’utilisation des outils de séquençage de nouvelle génération (Roche 454, Illumina MiSeq) pour caractériser les communautés d’invertébrés présentes dans des échantillons de sol ou issus d’extraction de faune.
    L’élaboration et la calibration du protocole ont été faites à l’aide d’échantillons d’invertébrés et de sols prélevés dans différents gradients environnementaux caractéristiques des écosystèmes du Nord-Ouest de la France.
Thème


 

Cote

  • 22010

Sujets

 








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